구제역 예방접종은 소와 염소에 대해서는 4월과 10월 연 2회로 나눠 일제접종을 실시하고 돼지는 모돈과 자돈으로 구분해 접종시기에 따라 수시접종을 실시한다. 

충북도는 구제역 예방접종 조기완료를 위해 시군과 축협에서 보유하는 있는 백신물량을 사전 점검해 차질없이 적기에 백신이 공급되도록 조치했다. 또 농가별 항체양성률을 높이기 위해 백신 보관방법과 접종요령을 홍보하고, 접종에 두려움이 있는 소규모 농가, 고령농가 등에 대해서 도내 55명의 공수의사를 주축으로 51개반 112명의 접종지원반을 동원해 누락 되는 농가나 개체가 없이 100% 접종토록 조치했다. 향후 농가별 예방접종 이행 여부를 확인하기 위해 12월 12일까지 육성돈 위탁농가, 밀집지역 사육농가, 항체양성률 저조농가 등을 중심으로 임상검사 및 항체검사를 실시할 계획이다.